Angebote und Serviceleistungen

In der CEP werden folgende wissenschaftliche und technische Dienstleistungen angeboten (zum Teil in Kooperation mit der Gewebebank):

Projektberatung:

  • Studiendesign und –planung, Modellauswahl
  • Modellvalidierung
  • Makroskopische und histologische Untersuchungen durch Veterinär- und Humanpathologen mit Expertise in Tiermodellpathologie/Labortierpathologie
  • Kooperationsprojekte für wissenschaftliche Veröffentlichungen/Präsentationen

Gewebeprozessierung

  • Paraffineinbettung und Anfertigung von Gewebeschnitten
  • Gefrierschnitte
  • Hämatoxylin-Eosin (HE) Färbung
  • Spezialfärbungen (auf Anfrage)
  • Immunhistochemie
  • inSitu-Hybridisierung o DNA-/RNA Extraktion (in Kooperation mit der Abteilung für Molekularpathologie (auf Anfrage)
  • Lasermikrodissektion (LMD, Leica)
  • Gewebearchivierung (derzeit nur Paraffinblöcke)
  • Light-sheet-fluorescence-Mikroskopie

Sektionsservice

  • Kleine Labortiere
  • Großtiere (nur auf Anfrage und vorherige Anmeldung)

Archivierung und digitale Verarbeitung

  • Scannen und Annotieren von Gewebeschnitten
  • Computergestütze Analyse (Definiens Tissue Studio®, Leica Aperio Algorithmen, QuPath)
  • Digitale Slide-Datenbank (Aperio eSlide Manager, Leica)

Tiermodell-Gewebebank

  • Erstellung von Tissue Microarrys (TMA) von Tiermodellen
  • Asservierung von Normalgewebe von häufig genutzten Maus- und Rattenlinien

Training

  • Kurse zu Gewebeentnahme und –asservierung
  • 1-wöchiger Lab Animal Pathology Kurs im Rahmen des PhD-Programms „Medical Life Science and Technology”
  • Kurse allgemeine und spezielle Sektionstechnik (Nagetiere)
  • Regelmäßige theoretische Seminare „Grundlagen der Tierpathologie“
  • Regelmäßige Vorlesung „Grundlagen der vergleichenden Pathologie bei tierexperimentellem Arbeiten“ im Rahmen des FELASA Aufbaukurses am ZPF
  • Kasten „Normalgewebe und speziesassoziierte Erkrankungen“ zum Selbststudium (derzeit im Aufbau, nur gegen Gebühr/Pfand).

Spatial Omics

  • Räumlich aufgelöste Transkriptomanalyse (Xenium in situ, 10x Genomics)
    • Einzelzell- und subzelluläre Auflösung
    • Gezielte Methode, die die Auswahl eines Genpanels voraussetzt. Derzeit ist die parallele Messung von hunderten RNAs möglich.
            
  • Gemultiplexte Antikörperfärbung (CODEX/Phenocycler, Akoya Biosciences)
    • Paralleles Auslesen von hunderten Antikörperfärbungen
       
  • Beide Methoden funktionieren sowohl mit Gewebeschnitten von FFPE-Proben als auch von gefrorenen (fresh-frozen) Proben.